生态毒理学报

2018, v.13(01) 138-146

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大气细颗粒物暴露后小鼠肺组织microRNA差异表达谱芯片分析
Microarray-based Analysis of Differentially Expressed MicroRNAs in Mouse Lung Tissue Induced by Particulate Matter

侯天芳;廖纪萍;马元元;张成;王广发;

摘要(Abstract):

microRNAs作为临床疾病早期诊断的新型生物标记物越来越受到重视,为了进一步探究其在大气污染暴露后引起疾病的分子染毒机制。本研究通过建立大气污染小鼠染毒模型,利用Agilent芯片筛查小鼠肺组织中microRNAs差异表达谱,并通过实时荧光定量PCR方法验证芯片结果,使用Target Scan,PITA,microRNAorg数据对差异mi RNA进行靶基因预测,进行靶基因富集的基因功能(GO)和信号通路(KEGG)分析。结果显示,大气细颗粒物暴露2周后小鼠肺组织microRNAs有显著差异表达谱,高剂量暴露组与对照组比较有4个mi RNAs上调,低剂量暴露组与对照组比较有2个mi RNAs上调,高剂量组与低剂量组比较,有4个mi RNAs上调(标准为fold change值>=2.0且P值<=0.05),挑选差异明显的mi RNAs进行q RT-PCR验证,mi R-139-5p、mi R-691及mi R-340-3p变化趋势与芯片一致,生物信息学结果显示,差异表达的mi RNAs所调控的靶基因明显富集于34个GO通路(包括RNA转录酶II启动子的转录,RNA拼接,DNA模板,蛋白质结合和核酸结合)和32个KEGG通路(主要集中轴突导向通路和癌症通路)。综上所述,大气细颗粒物暴露染毒可诱导小鼠肺组织中mi R-139-5p、mi R-691及mi R-340-3p明显上调,且生物信息学分析提示中枢神经系统发育及癌症通路可能作为PM2.5暴露相关差异表达mi RNAs调控靶基因介导的主要致病通路。

关键词(KeyWords): 大气污染;PM2.5;microRNA;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金面上项目(No.81370106);; 北京市自然科学基金重点项目(No.7161013);; 首都卫生发展专项研究重点攻关项目(No.2016-1-4071);; 北京大学临床研究项目(No.PUCRP201303);; 国家重点研发计划(No.2017YFC1309500)

作者(Author): 侯天芳;廖纪萍;马元元;张成;王广发;

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