生态毒理学报

2011, v.6(03) 281-288

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重金属暴露铜锈环棱螺全组织均一化cDNA文库构建及表达序列标签特征分析
Construction of Normalized cDNA Library and Analysis of Expressed Sequenced Tags Properties of Bellamya Aeruginosa

安立会;郑丙辉;王静波;张雷;李子成;付青;王春燕;赵兴茹;陈浩;王丽靖;尚晶晶;

摘要(Abstract):

构建cDNA文库是寻找生物新功能基因的有效手段。采用SMART技术构建了重金属铜和镉暴露铜锈环棱螺全组织均一化cDNA文库,文库库容为1.78×106克隆,重组率大于99%。从初始文库中随机挑取6000个克隆进行测序,获得5473个高质量表达序列标签(ESTs)序列。经聚类分析得到3961个Unigene(平均长度为815bp),其中包含897条重叠群(Contigs),3604条单拷贝EST序列(Singlets),冗余度为27.63%。对ESTs序列进行相似性功能分类(COG)、标准基因词汇体系(GO)功能分类和基因与基因组(KEEG)代谢途径的生物信息学分析。结果表明此文库含有大量的生长发育、细胞信号传导机制和生物防御机制等相关基因,为进一步筛选铜锈环棱螺功能基因奠定了生物信息学基础,也为发展铜锈环棱螺毒理效应研究提供了丰富的信息资源。

关键词(KeyWords): 铜锈环棱螺;重金属;均一化cDNA文库;表达序列标签

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家水体污染控制与治理科技重大专项(2009ZX07528-03);; 中国新型环境问题(2009467109)

作者(Author): 安立会;郑丙辉;王静波;张雷;李子成;付青;王春燕;赵兴茹;陈浩;王丽靖;尚晶晶;

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参考文献(References):

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