生态毒理学报

2019, v.14(01) 144-152

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双酚A诱导下双齿围沙蚕实时荧光定量PCR内参基因的筛选
Reference Gene Selection for Quantitative Real-Time PCR in Perinereis aibuhitensis under BPA Exposure

薛圣伦;黄艺;孙嘉;杨大佐;周一兵;赵欢;

摘要(Abstract):

为了筛选出在双酚A诱导下双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)体壁组织中最适内参基因,以不同浓度双酚A诱导下双齿围沙蚕互补脱氧核糖核酸(cDNA)为模板进行实时荧光定量PCR,利用Ge Norm、Norm Finder和Bestkeeper三个软件对肌动蛋白(beta-actin, Actin)、核糖体蛋白5(ribosomal protein L5, RPL5)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, GAPDH)、微管蛋白(β-tubulin, Tub)、琥珀酸脱氢酶(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A, SDHA)和组蛋白(Histone Cluster 1 H_2A Family Member A, HH_2A)这6个备选内参基因的表达量进行分析,筛选出稳定表达的内参基因。结果表明6个内参基因的基因表达量由大到小为Actin>GAPDH>SDHA>HH_2A>Tub>RPL5,Bestkeeper软件分析得到6种内参基因稳定性排名为Actin>RPL5>SDHA>Tub>HH_2A>GAPDH,Ge Norm软件分析得出6种内参基因的稳定性排名为SDHA>RPL5>Actin>Tub>HH_2A>GAPDH,Normfinder分析的结果为Actin>SDHA>RPL5>Tub>HH_2A>GAPDH。综合以上结果确定双酚A诱导下双齿围沙蚕最优内参基因为Actin,不推荐GAPDH作为内参基因使用。推荐同时选取多对内参基因进行实验,可以进一步减少误差。

关键词(KeyWords): 双酚A;双齿围沙蚕;内参基因;Actin

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 辽宁省大型仪器设备共享服务平台能力建设基金;; 农业农村部北方海水增养殖重点实验室开放课题(2018-KF-15)

作者(Author): 薛圣伦;黄艺;孙嘉;杨大佐;周一兵;赵欢;

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